Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calr4Q3TQS0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms