Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ctdnep1Q3TP92 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ctdnep1Q3TP92 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Ctdnep1Q3TP92 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctdnep1Q3TP92 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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