Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarca4Q3TKT4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarca4Q3TKT4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Smarca4Q3TKT4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms