Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RubcnlQ3TD16 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RubcnlQ3TD16 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms