Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem104Q3TB48 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem104Q3TB48 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms