Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Riiad1Q3KNY5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riiad1Q3KNY5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms