Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdss2Q33DR3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdss2Q33DR3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdss2Q33DR3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms