Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-M3Q31093 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M3Q31093 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms