Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Perm1Q149B8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms