Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne7Q0VE82 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne7Q0VE82 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms