Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kndc1Q0KK55 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kndc1Q0KK55 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms