Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tgm3Q08189 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgm3Q08189 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms