Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms