Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a2Q07643 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms