Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf3Q07104 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms