Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Siah1bQ06985 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms