Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a1Q05722 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a1Q05722 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms