Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top1Q04750 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms