Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nf1Q04690 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Nf1Q04690 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nf1Q04690 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nf1Q04690 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nf1Q04690 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nf1Q04690 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nf1Q04690 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms