Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms