Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1sQ02789 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1sQ02789 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms