Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col6a2Q02788 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms