Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ascl1Q02067 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ascl1Q02067 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ascl1Q02067 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ascl1Q02067 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms