Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uba1Q02053 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uba1Q02053 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms