Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2aQ01320 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms