Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde1bQ01065 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms