Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yy1Q00899 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Yy1Q00899 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms