Protein–RNA interactions for Protein: Q00898

Serpina1e, Alpha-1-antitrypsin 1-5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1eQ00898 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Serpina1eQ00898 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms