Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga4Q00651 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga4Q00651 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms