Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stx2Q00262 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms