Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VldlrP98156 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VldlrP98156 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VldlrP98156 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VldlrP98156 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms