Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pkp1P97350 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms