Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RptnP97347 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RptnP97347 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RptnP97347 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RptnP97347 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RptnP97347 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RptnP97347 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RptnP97347 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RptnP97347 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RptnP97347 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RptnP97347 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RptnP97347 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RptnP97347 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RptnP97347 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RptnP97347 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms