Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms