Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubg1P83887 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms