Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cct7P80313 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cct7P80313 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cct7P80313 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cct7P80313 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cct7P80313 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cct7P80313 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cct7P80313 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct7P80313 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms