Protein–RNA interactions for Protein: P70441

Slc9a3r1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r1P70441 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc9a3r1P70441 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc9a3r1P70441 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc9a3r1P70441 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms