Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tbx6P70327 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tbx6P70327 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms