Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NficP70255 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NficP70255 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NficP70255 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NficP70255 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NficP70255 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NficP70255 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NficP70255 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NficP70255 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NficP70255 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NficP70255 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NficP70255 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NficP70255 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NficP70255 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NficP70255 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NficP70255 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NficP70255 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NficP70255 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NficP70255 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NficP70255 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NficP70255 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NficP70255 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NficP70255 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NficP70255 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NficP70255 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NficP70255 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NficP70255 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NficP70255 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NficP70255 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NficP70255 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms