Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb4bP68372 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4bP68372 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms