Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab3cP62823 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rab3cP62823 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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