Protein–RNA interactions for Protein: P62500

Tsc22d1, TSC22 domain family protein 1, mousemouse

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d1P62500 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsc22d1P62500 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tsc22d1P62500 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms