Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snrpd1P62315 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms