Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp46P62069 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp46P62069 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp46P62069 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp46P62069 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp46P62069 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp46P62069 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp46P62069 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp46P62069 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp46P62069 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms