Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg6P61406 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg6P61406 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg6P61406 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg6P61406 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg6P61406 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg6P61406 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg6P61406 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg6P61406 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg6P61406 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg6P61406 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg6P61406 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg6P61406 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg6P61406 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg6P61406 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms