Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rin3P59729 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rin3P59729 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rin3P59729 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rin3P59729 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms