Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup43P59235 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup43P59235 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup43P59235 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms