Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarf2P59222 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf2P59222 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms