Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bace1P56818 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bace1P56818 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bace1P56818 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bace1P56818 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bace1P56818 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bace1P56818 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Bace1P56818 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bace1P56818 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bace1P56818 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bace1P56818 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bace1P56818 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Bace1P56818 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Bace1P56818 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bace1P56818 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms