Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gp1bbP56400 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms